Die Berliner Jungs Ben (Timon Wloka), Jonas (Timmi Trinks), Özzi (Ugur Ekeroglu) und die beiden Mädchen Leo (Janina Fautz) und Sophie (Stephanie Amarell) sind auf einer Klassenfahrt nach Hildesheim. Auf dem Plan stehen langweilige Besichtigungen.

Nach einer Explosion im Hildesheimer Dom finden sie heraus, dass hinter dem Anschlag eine fanatische Sekte steckt. Diese bringt die Jugendlichen in ihre Gewalt und plant ein Ritual. Ein abenteuerlicher Wettlauf gegen die Zeit beginnt, der die fünf Freunde durch Grabkammern, Verliese und ein altes Bergwerk führt.

Der Kinofilm ALLEIN GEGEN DIE ZEIT basiert auf der gleichnamigen deutschen Krimiserie, die von 2010-2012 auf dem Sender KIKA ausgestrahlt wurde. In die Charaktere der Freunde schlüpfen wieder dieselben Schauspieler wie zur Zeit der Serie.